常见的方法有，向水中添加氯和漂白粉；使用氯胺对水进行杀菌；使用二氧化氯进行杀菌；使用臭氧进行消毒；使用NEUTHOX杀菌溶液。前三种方法通常水中会有大量余氯残留，造成二次污染；使用臭氧的话成本较高；NEUTHOX杀菌溶液，因为它可以清除管道内壁湿滑的生物膜，杀菌彻底，且杀菌后分解绿色安全。
漂白粉直接消毒法。我们会取用适当的漂白粉和清水一起搅拌均匀，然后等待一些时间，最后取一些直接投入到需要使用的水中，一般需要等到12小时候以后才能饮用。使用消毒灵进行消毒。这种方法比较简单，有的农村如果需要消毒的话会用到这种方法，因为携带和操作都很方便，而且经济实惠。二氧化氯消毒法。
饮用水杀菌消毒一般有下面五种方法：一：使用氯和漂白粉 二：使用氯胺 三：使用二氧化氯 四：使用臭氧 五：使用紫外线辐射 前三种由于会有二次污染，所以现在不建议采用。用臭氧，成本又太高。所以建议还是用紫外线消毒。紫外线消毒具有杀菌快、杀菌率高、无二次污染且维护简单费用低等优点。
1、水的消毒方法可分化学的和物理的两种。物理消毒方法有加热法、紫外线法、超声波等法。化学方法有加氯法、臭氧法、重金属离子法以及其他氧化剂法等。其中以加氯法使用最为普遍，因为氯的消毒能力强，价格便宜，设备简单，余氯测定方便；便于加量调节等优点而得到广泛应用。
2、物理消毒法有加热法、γ辐射法和紫外线照射法等；化学消毒法有投加重金属离子（如银和铜）、投加碱或酸、投加表面活性化学剂、投加氧化剂（氯及其化合物、溴、碘、臭氧）等的消毒法。在这些方法中以氧化剂消毒应用最广，其中以氯及其化合物消毒尤为通用，其次是臭氧消毒。
3、目前在我国城市居民供水处理中，最常用的消毒手段包括氯气消毒、二氧化氯消毒、臭氧消毒以及紫外线消毒等。氯气消毒由于其优越的消毒效果、简便的操作过程以及较低的成本，成为供水行业中广泛采用的方法。
井水常用漂白粉或漂白粉精片进行消毒。\x0d\x0a（1）直接加氯消毒法：消毒时间和次数应根据用水量和担水的时间决定。在一般情况下，公用井可分早、午、晚各1次或每日2次，用水量较小的家庭水井每日1次即可。
喷洒消毒：对池壁（顶部）进行喷洒消毒，用含氯量300毫克/升的消毒药物喷于池壁（顶部）周围，停留一段时间，然后用清水冲洗干净。浸泡水池与管道：打开上、下水池进水阀放入自来水至满水位并投加浸泡消毒用的消毒药物，一般取消毒浸泡浓度为余氯10毫克/升，浸泡时间为30分钟至1小时。
食醋（白醋也可以用），也能对水进行消毒。在净化过的水中倒入一些醋汁，搅拌后，静置 30 分钟，便可饮用。只是水中有些醋的酸味。煮沸消毒 在海拨高度不太高（海拨 3000 米以下）且有火种的情况下，反水煮沸5 分钟，也是对水进行消毒的很好的方法，且简单实用。
对深水井中的泥沙进行净化和消毒处理有几种简便可行的方法。
